Une excursion en catamaran à l'île de Taboga traverse des eaux que la couronne espagnole surveillait de près. Francisco Pizarro a approvisionné une partie de son expédition au Pérou dans ce mouillage, et l'ancrage abritait des galions transportant de l'argent vers le nord, vers Portobelo.
La seconde vie de Taboga fut industrielle. En 1840, la Pacific Steam Navigation Company y a construit des quais à charbon et des ateliers de réparation, et pendant plusieurs décennies, le port de l'île a traité plus de transport maritime dans le Pacifique que Panama lui-même. Des ouvriers sont venus de Jamaïque, d'Équateur et du Pérou. En 1887, Paul Gauguin, fauché et fiévreux après avoir creusé sur le canal français raté de Ferdinand de Lesseps, s'est rétabli à Taboga avant de naviguer vers la Martinique ; ses lettres décrivent une lumière qu'il poursuivra plus tard en Polynésie. Un hôpital pour la fièvre jaune a suivi, puis une petite ère de villégiature dans les années 1950. La traversée a survécu à chacune de ces réinventions, et aujourd'hui, les billets d'excursion en catamaran à l'île de Taboga suivent le même cap que les paquebots à vapeur autrefois. Une excursion en bateau conventionnelle à l'île de Taboga le suit également.
La nature détient le reste de l'île. Le refuge faunique des îles Taboga et Urabá, établi en 1984, abrite l'une des plus grandes colonies de reproduction de pélicans bruns sur la côte Pacifique des Amériques, ainsi que des fous bruns nicheurs et des frégates magnifiques. Le Cerro Vigía grimpe à 307 mètres derrière le village. Un banc de sable de marée relie le village au rocher d'El Morro, apparaissant et disparaissant deux fois par jour. Les bougainvilliers et les hibiscus se répandent dans les ruelles blanchies à la chaux, c'est pourquoi les Panaméens appellent l'endroit Isla de las Flores, l'île aux fleurs, depuis la majeure partie de deux siècles. Les traversées annoncées comme une excursion en catamaran tout compris à l'île de Taboga au départ de Panama jettent l'ancre au large de Playa Honda, en vue de ces falaises.
Le point de départ est lui-même un artefact du canal : l'Amador Causeway a été posé à partir de roches excavées lors du creusement du canal de Panama, reliant quatre îlots au continent à l'embouchure pacifique de la voie navigable. Les navires travaillent sur la jetée tous les jours de 08h00 à 17h00, et le plus grand ferry catamaran de la ligne transporte plusieurs centaines de passagers à la fois. Chaque arrivée contribue à hauteur de 1 USD, une taxe environnementale municipale qui paie le nettoyage des plages sur une île d'environ mille habitants. Les excursions en catamaran à l'île de Taboga, les propriétaires de résidences secondaires et les familles du dimanche de la capitale partagent désormais la même étendue d'eau de vingt kilomètres que les pilotes de Pizarro ont cartographiée il y a cinq cents ans.
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